- Metabolic network reconstructions for Bacteria
http://sb.nhri.org.tw/MrBac/
- Contig Integrator for Sequence Assembly of Bacterial Genomes
整合各種不同組裝工具所產出的序列，找出相互吻合的序列片段，最後提供一組整合後的基因體序列。
http://sb.nhri.org.tw/CISA/
- A software platform for GEnome-scale Metabolic model Simulation, Reconstruction and Visualization
開發可針對全基因體的代謝網絡模型進行模擬、重建與及圖形化介面的呈現的軟體平台GEMSiRV。
http://sb.nhri.org.tw/GEMSiRV
